名师讲座
报告题目：高通量核酸智能化并行性分析及疾病诊断应用
报告时间：2025-05-29 09:00
报告人： 宋萍 副教授
上海交通大学生物医学工程学院
报告地点：卢嘉锡楼202报告厅
转播地点：翔安校区能源材料大楼3号楼会议室3，漳州校区生化主楼307教室
报告摘要：
核酸分析是解析基因功能、研究疾病机制及实现精准医学的重要手段，尤其在肿瘤等重大疾病的早期诊断、术后监测及个性化用药指导中发挥着不可替代的作用。然而，当前核酸变异分析面临通量低、灵敏度不足、多靶点协同检测困难等瓶颈问题，尤其是在液体活检等领域，痕量低丰度核酸变异的检测尤为困难。针对这些挑战，课题组聚焦于高通量核酸智能化并行性分析技术的开发与应用，旨在解决核酸变异分析中通量低、灵敏度不足及多靶点协同检测困难等瓶颈问题，特别是在液体活检中痕量低丰度核酸变异的检测挑战。通过提出“核酶热动”核酸分子探针杂交扩增模型，揭示了提升高通量核酸特异性扩增的关键机制，并基于热力学碱基堆积智能计算方法，构建了精准预测核酸杂交扩增的新模型。在此基础上，智能化设计了高通量核酸探针，突破了传统方法通量限制，实现了十万级核酸单管智能均一扩增分析，扩增通量较常规方法提升1000倍，并构建了针对低频点突变、融合基因、片段缺失和嵌入等多种突变类型的高灵敏检测体系。进一步开发了痕量核酸低频突变的高通量检测新方法，仅用一重探针即可检测87个突变，检测限降低10倍，时间缩短4倍，成本减少50倍，成功应用于结直肠癌、黑色素瘤等肿瘤的精准分型及个性化用药指导，相关技术已转化并应用于分子诊断和生物制药领域，为肿瘤精准诊疗提供了重要的工具和方法，具有显著的临床转化潜力。
报告人简介：
宋萍，上海交通大学生物医学工程学院副教授，博士生导师，核酸生物医学工程课题组长。获国家海外优秀青年项目，教育部优秀创新创业导师，上海市海外高层次人才计划，上海交通大学“小米学者”。主持国家自然科学基金面上项目，主持和参与科技部重大专项研发计划，上海市医学创新专项项目，上海交通大学医工交叉重点项目及STAR项目等。2016年博士毕业于中科院上海应用物理研究所。2016 - 2021年于美国Rice University从事博士后和高级研究科学家的研究工作。2019 - 2021年兼职在NuProbe Inc USA一家跨国疾病诊断公司担任高级研究科学家并负责多个产品的研发。主要研究方向包括1）智能核酸探针高通量设计及应用，2）基因组和转录组新技术的研发和临床应用，3）痕量核酸富集放大技术及肿瘤诊断。以第一作者（含共一）和通讯作者身份发表文章包括Nat. Chem.、Nat. Biomed. Eng. (2篇)、JACS、Nat. Commun.（2篇）、Angew.Chem. (3篇)、Nat. Protoc.等二十余篇。申请并获批10余项中国、美国以及国际专利，实现多项专利的产业化转化，已用于体外诊断及药物的研发。
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