名师讲座
报告题目：Computational Design of Functional Proteins
报告时间：2026-06-05 10:30
报告人： 徐纯福 研究员
北京生命科学研究所和清华大学生物医学交叉研究院
报告地点：化学楼234会议室
报告摘要：
Deep learning has rapidly reshaped protein design, enabling the creation of increasingly complex structures and functions with real-world applications. In this talk, I will trace this paradigm shift through a personal lens, from early efforts to parametrically design helical-bundle backbones using Crick’s coiled-coil equations to the emergence of hallucination- and diffusion-based generative models that now enable the routine creation of complex protein architectures. I will discuss how advances in deep learning–based structure prediction, sequence design, and generative modeling have dramatically accelerated the path from concept to experimentally validated function. Particular emphasis will be placed on the computational design of protein assemblies, transmembrane proteins, ligand-binding proteins, and protein-binding proteins, as well as their potential applications in therapeutics, diagnostics, and synthetic biology.
报告人简介：
徐纯福，北京生命科学研究所研究员，清华大学生物医学交叉研究院助理教授。复旦大学本科毕业，Emory大学博士毕业，随后在诺贝尔奖获得者David Baker教授实验室开展博士后研究。专注于蛋白质计算设计领域的研究，在具有全新结构的蛋白和多肽设计方法的开发、功能性蛋白质的从头设计等领域做出了先进的研究成果。开发的参数化α螺旋蛋白质设计方法（Science 2014）引领了领域科学进展，直接推动了一家美国初创公司的建立。跨膜蛋白孔的成功设计（Nature 2020）被同行高度评价,是跨膜蛋白设计的里程碑。成功设计了小分子激活的在近红外区有荧光活性的荧光蛋白，超出了现有所有荧光蛋白的光谱范围，为深层组织成像提供了可遗传编码的荧光探针。2022年起开始独立工作，并于2023年获海外优青资助。目前实验室研究方向聚焦于开发新的蛋白质计算设计方法并探索全新的功能性蛋白在生物技术和生物医药领域中的应用。
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化学化工学院
